He still sometimes had nightmares about what he'd seen in there

To jest czas Past Perfect (about what he'd seen) z czasem Past Simple (he still sometimes had). Czyli, on wtedy miał koszmary o tym, co zrobił wcześniej. Koszmary miał w przeszłości, a to, co zrobił zdarzyło się jeszcze wcześniej, stąd czas zaprzeszły.

Wydaje mi się, że ta notatka bardzo dobrze tłumaczy zastosowanie Past Perfect https://www.etutor.pl/lessons/en/b1/25/1/17743

W razie dalszych wątpliwości, pytaj śmiało:)