Dziewczyna siedziała za biurkiem czytając czasopismo???

Obie odpowiedzi są poprawne, ale druga bardziej sensowna.

Mi sie zawsze wydawało, że np. "sat" to będzie "usiadła" - krótka czynność, a "siedziała" to czynność rozciągająca się w czasie i użyjemy tu "was sitting". Mam rację, czy jest inaczej?

Mkodej ma rację.
Wg mnie zdanie "The girl sat at a desk reading a magazine" nie oznacza:
"Dziewczyna siedziała za biurkiem czytając czasopismo"
ale
"Dziewczyna usiała za biurkiem czytając gazetę", czyli czynność siadania była krótka, zaś dziewczyna np. stała i czytała gazetę, a potem zdecydowala się usiąść -i usiadła, czytając gazetę.

Kto wie jak to zgłosić szefom Etutor, żeby poprawili w systemie powtórek???

Dokładnie. Jest zasadnicza różnica między dwoma wyrażeniami:

sat - usiadła - czynność dokonana
was sitting - siedziała - czynność niedokonana

Zasadnicza różnica między dwoma czasami gramatycznymi Past Simple i Past Continuous - (nie)dokonanie.

Pozdrawiam :)